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蛋白质组学第2期-认识蛋白质组学原始数据
上周我们公布了，蛋白质组学习小组起飞啦！ 短短几天就获得了200多小伙伴的支持，让我们也更有信心的带领大家掌握一个蛋白质组学数据处理的实战，我们第2期学习内容是认识一下蛋白质组学的原始数据
第一期
1.读文章
《The Primary Effect on the Proteome of ARID1A-mutated Ovarian Clear Cell Carcinoma is Downregulation of the Mevalonate Pathway at the Post-transcriptional Level》
理清文章思路
总结蛋白质组学部分的流程
标出所用的软件及需要下载的内容
2.下载软件：MaxQuant
网址：https://www.maxquant.org/
下载
需要填写基本信息后下载
解压
点击图标即可进入
3.Raw文件下载
文中描述
(http://proteomecentral.proteomexchange.org)在搜索框输入 ID号 PXD004570
出现文章信息
Database FTP location
raw 一共12个质谱原始文件全部下载。
友情提示：
数据量稍微有一点大，如果你是个人电脑，建议跳过前面3个原始数据处理的步骤，直接从第5讲开始跟着练习，或者你可以考虑配置生物信息学数据处理服务器：72核心、72GB内存服务器集群（不到1000美元）
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