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Aviv Regev教授,细胞图谱对理解和治疗疾病的指导意义(6月23上午9点)

熟悉我们《单细胞天地》公众号团队的小伙伴都知道我们有一个长期的单细胞学徒培养腾讯会议,每天晚上九点。点击链接入会,或添加至会议列表:https://meeting.tencent.com/dm/EWBbxqqpD6Fa

  • 腾讯会议:507-1242-3763

  • 会议密码:2022

持续两百次,欢迎保留这个链接,随时参与。原则上每周至少五次单细胞单细胞,但是最近学徒不够用了,导致我们的两百次目标有点遥遥无期。

而单细胞领域,Aviv Regev教授的大名鼎鼎基本上无需我再次强调了,学徒们做单细胞数据集图表复现的时候也多次拿到了她老人家的文章。恰好在微信群看到了她的会议通知,没有理由不广而告之!

因为是海外会议,所以首选是zoom的参会方式哦,扫描下面的二维码即可!

绝大部分会议都是讨论科研方法和思路

并不是数据分析实战,一般来说单细胞数据分析主要靠的是计算机基础知识点,再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理

把R的知识点路线图搞定,如下:

  • 了解常量和变量概念
  • 加减乘除等运算(计算器)
  • 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子)
  • 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表)
  • 文件读取和写出
  • 简单统计可视化
  • 无限量函数学习

Linux的6个阶段也跨越过去 ,一般来说,每个阶段都需要至少一天以上的学习:

  • 第1阶段:把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅,主要目的就是去可视化,熟悉黑白命令行界面,可以仅仅以键盘交互模式完成常规文件夹及文件管理工作。
  • 第2阶段:做到文本文件的表格化处理,类似于以键盘交互模式完成Excel表格的排序、计数、筛选、去冗余、查找、切割、替换、合并、补齐,熟练掌握awk、sed、grep这文本处理的三驾马车。
  • 第3阶段:元字符,通配符及shell中的各种扩展,从此linux操作不再神秘!
  • 第4阶段:高级目录管理:软硬链接,绝对路径和相对路径,环境变量。
  • 第5阶段:任务提交及批处理,脚本编写解放你的双手。
  • 第6阶段:软件安装及conda管理,让linux系统实用性放飞自我。


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