分子分析揭示了迄今为止最古老的丹尼索瓦人化石
Jenne 自然部落：在过去十年中，DNA 测序技术和实验室预备方案的最新进展在时间和地理上迅速扩大了古代 DNA 研究的范围。发现包括古代人和现代人之间的相互作用以及现代族群动态，包括那些与末次冰盛期最大值和世界大多数地区的定居历史重合的人。这种新型数据使我们能够检查人类族群动态的过去，并加深对我们现在的理解。古代 DNA 领域的持续发展改变了我们对人类遗传历史的理解，将不断揭开我们进化历史的奥秘。
丹人主题本号发过一篇，也是基于赫赫有名的丹尼索瓦洞穴的考古研究。参考阅读来自丹尼索瓦洞穴的更新世沉积物 DNA。
自从十年前首次发现丹尼索瓦人以来，只发现了少数他们的遗体。在这里，研究人员使用胶原蛋白肽质量指纹图谱分析了约 3,800 块非诊断性骨骼碎片，以定位来自丹尼索瓦洞穴（俄罗斯西伯利亚）的新古人类遗骸。研究人员鉴定出了五块新的古人类骨骼，其中四块含有足够的 DNA 用于线粒体分析。三个携带丹尼索瓦人类型的线粒体 DNA，一个被发现携带尼安德特人类型的 mtDNA。前者来自洞穴序列底部附近的同一考古层，是丹尼索瓦人在 200 ka（千年前）（205-192 ka，概率为 68.2% 或 217-187 ka，概率为 95%）的最古老的安全年代证据。. 它们所在的地层环境包含大量石器和动物遗骸形式的考古材料，使我们能够确定与这些早期人类相关的物质文化，并探索他们的行为和环境适应性。迄今为止，骨胶原指纹识别和遗传分析的结合使丹尼索瓦洞穴的人骨数量增加了一倍以上，并扩大了我们对丹尼索瓦人和尼安德特人的相互作用及其考古特征的理解。本文只适合作为交流 学习 参考资料。
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丹尼索瓦洞穴的入口。图片来源：IAET，俄罗斯科学院西伯利亚分院
分子分析揭示了迄今为止最古老的丹尼索瓦人化石
马普学会
2021 年 11 月 30 日
由维也纳大学和图宾根大学以及马克斯普朗克学会的研究人员领导的一个国际团队，在西伯利亚南部丹尼索瓦洞穴的关键地点发现了五块新的人类化石。这些遗骸包括三名丹尼索瓦人和一名尼安德特人，是在一个安全且年代久远的约 200,000 年历史的环境中发现的。周围环绕着石器和食物垃圾等考古遗迹，该发现揭示了这些早期人类在欧亚大陆传播时的适应策略。
11 年前，西伯利亚南部阿尔泰山脉的丹尼索瓦洞穴一举成名，当时对一块小指骨化石的基因测序揭示了一个新的、以前未知的人类群体。尽管该团体以该遗址命名为“丹尼索瓦人”，但从洞穴中进一步确定丹尼索瓦人的遗骸一直具有挑战性，因为任何人类遗骸都极为零碎，并且很难在数十万具动物骨骼中找到. 由于没有确定的丹尼索瓦人遗骸，当他们到达这里时，他们如何生活，以及他们如何与与他们共享空间的其他人互动仍然是个谜。
在四年的时间里，由维也纳大学进化人类学系的卡特琳娜·杜卡 助理教授领导的团队与德国和俄罗斯的同事一起，从丹尼索瓦洞穴近 4,000 块骨骼碎片中提取和分析了古代蛋白质和 DNA 。他们的新发现发表在《自然生态与进化》上， 并为丹尼索瓦洞穴的第一批居住者及其考古特征提供了强有力的见解。
该团队使用一种称为肽指纹识别或 ZooMS（质谱动物考古学）的生物分子方法，重点研究了该地点最古老的地层，这些地层可以追溯到 20 万年前，直到现在还缺乏人类化石记录。这种方法是科学家在该遗址的数千块骨头中找到人类遗骸的唯一方法，因为超过 95% 的骨头太碎片化了，无法使用标准的识别方法。杜卡 ERC FINDER 项目的博士生、现任蒂宾根大学初级组组长萨曼莎·布朗分析了 3800 块长度不超过 4 厘米的骨头碎片，这些碎片以前被认为在分类学上无法识别。最终，布朗确定了五块骨头，其胶原蛋白与人类的肽谱相匹配。
用于分子分析的骨碎片。图片来源：萨曼莎·布朗
“找到一根新的人类骨骼本来很酷，但五块？这超出了我最疯狂的梦想，”布朗说。
“我们惊讶地发现新的人类骨骼碎片，可以在如此古老的层中保留了完整的生物分子，”杜卡说。
在五块新发现的人类骨骼中，四块含有足够的真实 DNA 片段，使研究人员能够重建他们的线粒体基因组。其中三个与丹尼索瓦人的 mtDNA 类型一致，一个与尼安德特人类型一致。可以追溯到 20 万年前，新的丹尼索瓦人骨骼是基因测序过的最古老的人类化石之一。
“丹尼索瓦洞穴是保存 aDNA 的绝佳场所，我们现在已经从一些最古老、保存最完好的人类化石中重建了新化石的遗传分析基因组，”莱比锡马克斯普朗克进化人类学研究所博士后研究员 迪延多·马西拉尼 博士说。
丹尼索瓦洞穴东侧洞穴的发掘。图片来源：IAET，俄罗斯科学院西伯利亚分院
新发现有助于弥合关于最早丹尼索瓦人的考古适应的差距。丹尼索瓦人在间冰期（环境和温度与今天相似的温暖时期）出现在该地点，并利用了洞穴的战略位置。他们以成熟的石器传统出现，利用附近阿努伊河冲积物中发现的原材料，捕猎食草动物，如野牛、狍和马鹿、瞪羚和赛加羚羊，甚至长毛犀牛。几千年来，他们继续遵循类似的生存模式。大约 130-150,000 年前，尼安德特人也出现在该地点，以当前研究中也发现的化石之一为代表。
团队成员，同样来自维也纳大学的汤姆·海厄姆 教授说：“像我们在丹尼索瓦应用的生物分子指纹技术的应用，让我们发现了比正式考古挖掘更多的人类化石。这是旧石器时代考古的一个巨大的技术突破。”
丹尼索瓦洞穴的研究将继续通过系统的实地考察和有针对性的骨骼和沉积物分析，俄罗斯考古学家团队每年在那里扎营近六个月。它仍然是迄今为止发现的唯一一个地点，其中包含所有三个主要人类群体丹尼索瓦人、尼安德特人和现代人在过去 200,000 年间周期性存在的证据。
探索
西伯利亚尼安德特人的食谱
来自沉积物的 DNA 揭示了丹尼索瓦洞穴的史诗般的历史
更多信息：萨曼莎·布朗等人，最早的丹尼索瓦人及其文化适应，自然生态与进化（2021 年）。
提供 马普学会
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