细胞图谱合集
分享是一种态度
作者 | 周运来
男，
一个长大了才会遇到的帅哥，
稳健，潇洒，大方，靠谱。
一段生信缘，一棵技能树，
一枚大型测序工厂的螺丝钉，
一个随机森林中提灯觅食的津门旅客。
随着单细胞技术的成熟，单细胞数据也在日益增长，这将为单细胞数据科学奠定数据基础。在不远的将来，单细胞数据挖掘也将成为生命科学的基础设施。只是在2020年的今天，大量的细胞图谱还处在原始的数据积累阶段，还没有像TCGA 数据库那样成熟。这就像远处的晨曦闪着的微光，早起的人总会不由自主地驻足观望。
要做数据挖掘，第一条肯定是要有数据，好在这些图谱的数据都是比较方便下载的。一般是csv，loom, cellranger 输出矩阵格式的，下载来直接用我们熟悉的单细胞工具就可以做了。
今天，你们家运来哥哥就带你看看现阶段人类已经构建的细胞图谱，走吧~
人类细胞图谱计划：
https://www.humancellatlas.org/
人类肺细胞图谱
https://hlca.ds.czbiohub.org/
人类细胞图谱（Human Cell Landscape）
https://db.cngb.org/HCL/
人类蛋白质图谱
https://www.proteinatlas.org/
小鼠细胞图谱
http://bis.zju.edu.cn/MCA/index.html
肠道细胞图谱
https://www.gutcellatlas.helmsleytrust.org/
https://www.gutcellatlas.org/
人类肾脏细胞图谱
https://www.kidneycellatlas.org/
COVID-19 Cell Atlas
https://www.covid19cellatlas.org/
看了这么多细胞图谱，我们也许会反问自己：到底什么是细胞图谱？
13种人体组织的单细胞RNA测序鉴定人类冠状病毒感染的细胞类型和受体
Seurat教程上新||Mixscape : 用多模态单细胞数据筛选免疫检查点
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