CP2K从头算分子动力学模拟技术与应用
2023
CP2K从头算分子
动力学模拟与应用
CP2K是一款较为强大的AIMD计算程序,免费开源,可高效并行。由于CP2K在做DFT时可以速度非常快地计算成千上万个原子的体系,因此在大规模模拟体系中经常被一些学者用到。比如计算原子数达到一千原子,计算时间可达到纳秒级别,这是非常诱人的!!从CP2K官网可以看到,一些学者已经用它在一些高大上的期刊上发表了研究成果。
01
课程大纲
CP2K从头算分子动力学模拟技术与应用
课程 | 内容 |
赠送预习视频内容 基础理论知识 | 高斯平面波混合方法(GAPW) 从头算分子动力学模拟原理(AIMD) cp2k在ubuntu系统的安装 |
第一天 上午 | 1. CP2K基础知识 1.1. Inp文件结构格式 1.2. Inp文件基本语法结合实例,讲解inp文件常用命令 1.3. 基组和赝势 1.4. CP2K重要关键词详解 |
第一天 下午 | 2. CP2K程序实际计算过程 2.1. CP2K 基组赝势的选择和设定 2.2. CP2K优化方法:单点能的计算 2.3. 晶胞优化 2.4. 几何结构优化 2.5. 吸附分子体系的优化 2.6. 静态频率计算 2.7. VMD、VESTA可视化 案例分析:不同体系的结构优化(气液固) |
第二天 上午 | 3. CP2K程序计算过渡态 3.1. 过渡态计算、过渡态判据 3.2. 寻找过渡态方法,传统 PEB 方法 3.3. CI-NEB方法计算过渡态 案例分析:CO2的加氢模拟 |
第二天 下午 | 4. CP2K程序计算态密度和能带 4.1. 态密度和能带形成的基本理论 4.2. 单原子催化剂,表面离子缺陷态,表面态,d带中心,催化吸附的轨道相互作用模型 4.3. CP2K的DOS后处理和pDOS计算分析 案例分析:WO3态密度研究 |
第三天 上午 | 5. 从头算分子动力学计算 5.1. AIMD输入文件 5.2. 轨迹图的制作 5.3. 结构数据的后处理分析 5.4. 径向分布函数RDF 案例分析:液态水的AIMD模拟 |
第三天 下午 | 6. 自由能势能面计算 6.1. 自由能势能面基础知识 6.2. Potential of mean force 6.3. Slow-growth 6.4. Metadynamics方法 6.5. 计算自由能势能面 案例分析:Au20/TiO2(110)AIMD模拟 |
第四天 上午 | 7. 电子结构分析 7.1. CP2K计算电荷密度 7.2. 自旋密度 7.3. HOMO/LUMO分子轨道 7.4. 电荷密度差分 7.5. 平面平均的电荷密度 7.6. Bader 电荷 案例分析:QM/MM模拟KCl表面 |
第四天 下午 | 8. 复现文献案例以及如何进行分析 8.1. 文献案例分析: 2d -硼片作为锂离子电池负极材料的可能应用:DFT和AIMD研究 8.2. 复杂体系的建模 8.3. Gromacs对CP2K的结果后处理 |
案例图示
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报名须知
培训时间
2023年04月08日-04月09日
2023年04月15日-04月16日
在线直播授课4天
报名费用
(含报名费、培训费、资料费)
CP2K从头算分子动力学模拟技术与应用:¥3700元/人
联系方式