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三项小鼠大脑图谱研究掀起讨论热潮：科研究竟应不应该包含雌鼠？

投必得学术 2023-03-16


本周，在推特上，三项关于小鼠的研究——两种小鼠大脑中的细胞类型，以及一项关于行为性别差异的研究——吸引了研究人员的注意力。



哺乳动物大脑的功能依赖于各种特殊细胞类型的规格和空间定位。然而，细胞类型的分子身份及其在个体解剖结构中的位置仍不完全清楚。为了构建每个大脑结构中细胞类型的综合图谱，我们将高通量单核RNA序列与Slide序列配对，这是一种最近开发的具有近细胞分辨率的空间转录组学方法。这些数据集的整合揭示了每个神经解剖结构的细胞类型组成。

一项关于小鼠的混合研究让科学家们在推特上掀起了一场风暴。这一切都始于“整个小鼠大脑的两个巨大的空间图谱”，由两种技术生成的整个小鼠大脑的两个巨大空间图谱。其中一个图谱是由华盛顿州西雅图艾伦研究所的研究人员开发的，它结合了两个单细胞数据集：约700万个细胞的RNA测序数据集，以及约430万个细胞的空间转录组数据集，这些数据集通过多重误差-鲁棒性荧光原位杂交(MERFISH)绘制。

艾伦脑科学研究所(Allen Institute for brain Science)的Hongkui Zeng在推特上写道，该图谱“是对哺乳动物大脑细胞和回路功能、发育和进化进行深入综合研究的基础资源”。艾伦研究所的Delissa McMillen回答说：“很快，我们在这项研究中产生的所有数据将被公布给所有人使用。我迫不及待地想看看世界各地的科学家们能从中得出什么结论。”

根据3月8日发表的预印本，第二份小鼠图谱来自马萨诸塞州剑桥市Broad研究所的研究人员，他们使用了“Slide-seq”，这是一种最近开发的具有近细胞分辨率的空间转录组学方法。新研究发现，中脑、后脑和下丘脑的细胞类型多样性非常高，大多数集群需要至少三个离散基因表达标记的组合才能唯一定义它们。利用这些数据，研究人员开发了一个遗传访问每种细胞类型的框架，全面表征了神经肽和神经递质信号，阐明了活性调节基因表达的区域特异性，并确定了神经和精神表型的遗传力富集。这些作为在线资源
（BrainCellData.org）提供的数据应该可以在神经科学中找到不同的应用，包括构建新的基因工具，以及在脑疾病研究中确定特定细胞类型和电路的优先顺序。

Broad研究所成员、首席研究员Evan Macosko说：“我们找到了所有细胞类型的最小标记集，探索活性调控基因，并进行遗传富集分析。我们发现所有细胞类型的最小标记集，探索活性调控基因，并进行遗传力富集分析。”

哈佛大学的Sandeep Robert Datta说，在本周发表在《当代生物学》(Current Biology)上的另一项小鼠研究中，研究人员质疑了雌性小鼠使实验复杂化的假设，因为“发情周期使所有雌性鼠的行为都比雄性鼠更多变，新研究实力展示‘这是真的吗？’”

研究小组使用Datta实验室首创的运动测序(MoSeq)方法，研究了雌性小鼠在发情周期不同阶段的野外行为。研究小组发现，激素周期对雌性小鼠行为的影响微不足道，实际上雌性小鼠的变化比雄性小鼠更小。研究人员得出结论，两性都应该用于实验，“出于许多重要的原因，每个人都应该在实验中使用两性。但如果你在研究自发探索时被迫选择一个性别来使用，我们的数据表明性别应该是雌性，”Datta说。

卡罗林斯卡学院的Silvia Maioli在推特上写道：“再也没有理由把雌性小鼠排除在研究之外了。”

参考文献
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
The cell type composition of the adult mouse brain revealed by single cell and spatial genomics
Mouse spontaneous behavior reflects individual variation rather than estrous state

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转自：神经生物学
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