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如何获取文献

2017-01-21 Y叔 biobabble


这篇竟然有标明作者,除了上面这段话不是我写的,其它全部照抄,当然他还加了一点点,那就是去截了屏。比如下面这段,我给了自己google profile链接,他就去截屏,然后这样子作者就不是我了?!差评!


里面提到了google reader,提到了friend feed,可想而知我最初写的时候,年代久远了。历史版本只update过一次,就是加上了sci-hub,最初写的时候,还没有sci-hub呢。


不做更改,原文录入如下:

这个题目又标题党了,不过是share一下一些地球人都应该知道的小tips而已。

据说是电信出口出了问题,学校里这两天大家都在叫pubmed上不去,我反正是上得去,就是慢点。大家好像少了pubmed就无法干活似的,不过也是,正所谓:熟读唐诗三百首,不会作诗也会吟。

1.有备无患

pubmed上不去,完全没影响,因为hubmed,hubmed主页上写着:An alternative interface to the PubMed medical literature database,所以完全可以把它当作是pubmed的镜像。这个站点至少我在暨大上是超级快的。搜完底上还有链接,让你很方便地用同样的关键词在google (scholar),Scirus, CrossRef,EBIMed等其它数据库里搜。

另外一个备选的站点是,这个站点的亮点是整合了ontology。

最近欧洲大名鼎鼎的EBI也开始搞文献服务了,新开的,我比较喜欢它的排序功能,可以按文章的相关性或引用数来排。除了文献之后,还可以biological patents, clinical guidelines, PhD theses and research reports。这个站点现在刚创立,我觉得一两年之后,肯定会有更多的服务提供,前途无量啊。

2. 文献管理

读文献是人干的事,管理文献却是疯子干的事。如果你还活在手工整理文献的黑客帝国里,请赶紧吞下。

3.个性化推荐

上网买本书,电商都会推荐给你,某本书可能你也想买。这是个性化推荐的时代,读文献也不例外,Google Scholar的新功能My updates,干的就是这个事,可以根据自己文章的内容,推荐相关的最新文献,想要用到这个功能,你需要建立页面。

4.订阅

RSS改变了人类的阅读,很多的期刊都提供了RSS,如果你是火星人,不知道啥是RSS,那么打开你的QQ邮箱,点一下阅读空间,那玩意实现的就是RSS订阅了。个人比较推荐。

另一个值得一提的是NCBI的个性化服务,你可以设定关键词,当pubmed上有新文献和这个关键词匹配的话,NCBI可以定期给你发邮件提醒。

5.求文献

科研大军越来越庞大,笑到最后的是各大出版社,不是读者给它送钱,就是作者给它送钱,当我们点full text时却被告知没付费么有permission,天下文章一大抄,没得抄是多么的不爽。我以前喜欢在FriendFeed上的references
wanted里求下载。不过上friendfeed需要。现在好了,国内的丁香园有个的功能,是个求文献的好去处。

6.下文献

文献下不了,很多时候是不用求的,sci-hub.org这个代理就是个下文献的好地方,比如Phosphoproteome profile of human lung cancer cell line A549这篇文章的网址是,把URL加上sci-hub.cc这个代理,变成,就可以下到相应的PDF文件。


再说明一下吧,第2点红色药丸的梗,不知道大家有没有看出来,可不是和饭岛爱共进晚餐时吞下的蓝色药丸哦。我说的是黑客帝国里,Morpheus刚找到Neo的时候,给他吃的那颗,红色药丸。原文链接到一个介绍文献管理的文章,让你看清文献管理的真面目。我自己一直以来用Zotero,因为跨平台,有firefox就行了。

再说RSS,很多人也许会陌生,但你们订阅公众号,说白了,也是一样的道理。有新的文章,你自己不用去查,不用去跟进,它自动推送给你。RSS订阅,就是给你自己推送,你订阅某个杂志,比如Bioinformatics,你完全可以不错过每一篇文章,因为每篇都会推送给你。大家可能也不知道什么软件可以干这事,以前我最爱用的google reader,因为google关了,后来我也不怎么用桌面软件了。RSS的身影随处可见,像上面提到的QQ邮箱里阅读空间,你其实是可以拿来订阅杂志的,不单单是QQ空间,豆瓣的9点也是个RSS订阅器。

求文献里提到的FriendFeed,以前也经常挂在上面,转眼也将近有10年了。那是twitter兴起时,google搞的类似产品,它还可以有类似于群组或房间的功能,当年就有reference wanted这样的群组,每次我需要文章,往上一贴,都是极快的速度,就有人发给我邮箱。可惜google把早期的好产品也关了,等到facebook什么的都牛逼了,又弄什么google plus,没意思。我相信抄这篇文章的小孩必定是没见过friendfeed的,如果你见过,不好意思,你已经暴露年龄了。

‘一支红杏出墙来’也是个链接,我以前写的一篇说中国人因为建筑是平面的,各种翻墙约会的梗,而西方则是各种爬窗,做为中国人,我们都应该会翻墙!


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