不靠谱的富集软件太多了！

Y叔 YuLabSMU 2022-09-20

哟西，图片上有GO和Reactome的条目，总的注释基因数是一样的，那么提问的这个问题就确实存在，而且不混的话，估计也没什么注释的覆盖度可以这么高，达到两万四千多个！超几何分布无非N, M, n, k四个参数，混起来等同于说把N变大而其他三个数不变，这样p值就小了。像KEGG这种人的基因注释的不到一万，N值却被设为两万多，一大波不显著的的都变得显著了，我收到很多人的邮件问我说，为什么用别人的软件富集出来，用我的软件却富集不出来，或者条目变少了，我也很无语，因为我写的软件靠谱好么😜