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生信技能树论坛的生信基础板块-统计学

王hh 生信菜鸟团 2022-06-07

如果你是最近关注我们,你将又知道一个学习生信的好地方;

如果你是一直关注我们,你肯定对这个地方不陌生;

那就是我们的生信技能树论坛(附上网址:http://www.biotrainee.com/forum.php)。

本周为大家带来论坛-生信基础版块的介绍,本篇是其中的“统计学“子版块,会对目前此子版块中的文章进行一个汇总整理(截止2017.11.24)。

原文列有文章对应的超链接,点开直达技能树原文,诚意满满~(●'◡'●)


统计学基础

  • 各种统计学计算公式 -by ydchen

  • 如何学习统计学-HOW TO STUDY STATISTICS -by Jimmy

  • 推荐一本统计学相关的电子书 -by Jimmy

  • nature杂志的统计学集合文章 -by Jimmy

生物统计基础

  • 第一章 常用统计学术语(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第二章 试验资料的整理与特征数的计算(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第三章 概率 与 概率分布(生物统计学基础 zckoo007

  • 第四章 统计推断(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第五章 χ2检验(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第六章 方差分析(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第七章 直线相关与回归分析(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第八章 可直线化的非线性回归分析(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第九章 常用试验设计及其统计分析(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第十章 协方差分析(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第十一章 多元线性回归与相关分析(生物统计学基础 -by zckoo007

  • 第十二章 逐步回归和通径分析(生物统计学基础) -by zckoo007

  • 第十三章 多项式回归分析(生物统计学基础)(完) -by zckoo007

生信相关实际问题

  • 如何处理批次效应(batch effect)-转载 -by ydchen

  • 为什么说FPKM和RPKM是错的 -by ydchen

  • percentile rank百分比排名,也可以用来定量基因表达量 -by Jimmy

  • 数据测量水平(Measurement Level)可以分为四类 -by Jimmy

  • Kaplan-Meier生存分析中三种检验方法的比较 -by Jimmy

  • 2008年就有68种做富集分析的工具了! -by Jimmy

  • 差异分析中foldchange和显著性P值阈值的选择问题-biostar -by ydchen

  • 不是只有WGCNA里面才有hub genes的概念 -by Jimmy

  • 什么是network analysis -by Jimmy

  • 什么是quantile normalization -by Jimmy

  • 富集分析的统计学本质探究 -by Jimmy

  • quantile normalization到底对数据做了什么? -by Jimmy

  • 对数据做对数转换会改变相关性吗? -by Jimmy

  • 数据标准化的原因及方法 -by ydchen

  • PCA和MDS降维的区别 -by Jimmy

  • GWAS精细定位 -by ydchen

  • 多个芯片数据要想联合起来分析,可以考虑ComBat 这个R-package -by Jimmy

Machine learning

  • 只需十四步-从零开始掌握Python机器学习 -by ydchen

  • AI, machine learning, and deep learning的区别 -by Jimmy

  • 机器学习算法分类 -by ydchen

  • 机器学习算法优缺点集锦 -by ydchen

  • 机器学习算法常用指标总结 -by ydchen

  • 5分钟弄懂监督学习、无监督学习、半监督学习与强化学习 -by ydchen

  • PCA分析 -by ehbio

  • 主成分分析原理和应用 -by ehbio

  • 聚类分析与判别分析的区别与联系 -by ydchen

  • 你分得清人工智能、机器学习、深度学习吗? -by ydchen

  • 主成分分析 -by Jimmy

  • 稀疏性分析(rarefaction analysis)和稀疏性曲线rarefaction curve -by ydchen

  • 层次分析法-ahp -by Jimmy

  • 你值得了解的七种回归技术 -by chenqu

  • 【板块例子】差异分析的统计学本质探究 -by Jimmy

  • 为什么不能用t检验取代方差分析 -by ydchen

R语言

统计学与R语言一起学,更配哦!

  • 用Hmisc包的rcorr函数对表达矩阵各个样本算相关系数及P值 -by Jimmy

  • 一起了解统计学和R语言 -by fei081

  • R语言自学入门之“rJava”程辑包或名字空间载入失败 -by medica

  • psych包中的corr.test()做矩阵的相关性检验 -by ydchen

  • 用R语言来实现逻辑回归 -by Jimmy

  • 第九届中国R语言会议(上海会场)报导 -by xuehzh95

  • 生物统计学与R手札 -by SickHome

  • 常见概率分布及在R中的应用 -by ydchen

  • R语言做coxPH建立生存对象Surv和右删失censoring的问题 -by 鸡血

Others

  • 难于上天的微积分是如何被创立的? -by ydchen

  • 差异有统计学意义不代表有实际意义! -by ydchen

  • 一个差异有统计学意义,有时候还不够! -by ydchen

  • 有统计学差异,不代表这差异是由干预造成的! -by ydchen

  • 分辨真假数据科学家的20个问题及回答 -by ydchen




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