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[变异毒株]Delta家族最新动态(第二集)

拍老师 拍照稀烂的焦虑怪 2021-11-25

第一集请见这里:[变异毒株]Delta家族最新动态


Delta已经疯了。


上一集讲到,截止2021年10月1日,Delta家族共有41位成员。


这才刚刚一周,又添了新丁——AY.4.3。


——请品鉴:


上图红色部分就是AY.4.3。


但这并不算啥。


真正可怕的是,一周时间内,就冒出来15个Delta系的子毒株申请正在排大队等待Pango Team评估和命名……



另外就是,Delta家族内部吧,也已经开始玩长江后浪推前浪的老套路了。

比如说,最新的战场——智利


——请品鉴:

上面是比利时鲁汶大学Tom Wenseleers老师搞的智利各毒株流行率变化趋势多项式拟合。


(这里顺便插一嘴啊,Wenseleers老师这个多项式拟合是市面上预测流行率走向最准的工具之一,当初早在4月底就精准预测出B.1.617.2必将一桶浆糊,属实牛鼻)


Anyway,智利这地方,之前对于Delta来说一直都是一根难啃的骨头。


早在6月初智利就出现了Delta的社区传播,但流行率一直被Lambda和Gamma牢牢压制住。


后来市占率被南美三雄的另外一家Mu撕开了口子,然后Delta军团(B.1.617.2、AY4、AY.20、AY.25和AY.26)才开始慢慢站稳脚跟,


但相对增长率只是差不多跟Mu打平而已……


直到,AY.34出现(上图紫色曲线),


瞬间原地起飞……


——或者把这货单独拎出来走几步吧,请品鉴:


69%的相对传播优势可还行?



哦对了,由于Delta开枝散叶太快太猛,Pango的毒株定义机器学习系统这几天被玩坏了……所以很多关于AY系列的毒株划分都(暂时)不太准,没法反映演化树的真实分叉情况。

于是NextStrain系的大佬们(主要是巴塞尔大学的Richard Neher老师、Emma Hodcroft老师和哈金森肿瘤研究中心的Trevor Bedford老师)坐不住了,今天更新了很久没有动静的NextStrain命名体系,把Delta拆分成了21A、21I和21J三个分支:

简单来说,Pango的毒株分类比NextStrain更细化,能最大化反映演化树分叉,但代价就是容易被玩坏……两者(关于Delta)的对应关系可以参照下表:

如上图,纵轴是Pango系统的各Delta子毒株,横轴则是NextStrain系统的Delta三大分支。

具体来说,21I和21J的流行趋势如下。

——21I,请品鉴:

——21J(Delta家族的主流),请品鉴:

——NextStrain版长江后浪推前浪示意图,请品鉴:

哎~

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