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[抢个跑]关于BA.4和BA.5的一些小八卦

拍老师 拍帮主 2022-10-06

前言

各位晚上好~关于变异毒株,似乎咱们这边儿又双叒叕一次抢跑全网一周~
详见:[抢跑]BA.4,即将登场(说不定还有BA.5哦)
鉴于今天后知后觉的主媒终于开始热炒这个话题了,
所以咱们就继续抢跑一点新鲜玩意儿吧~



首先咱不得不先跑个题,

略微批判一下某些自诩为“病毒猎手”的自媒写手,

比如:《饱受瞩目的奥密克戎两大新毒株BA.4与XE,谁会取代BA.2成为新毒王?》(by 病毒猎手 梅斯医学)

篇都是基本事实错误,

实在是看得让人抠脚……


——特别是这部分:


——简而言之,这事儿的原委其实是这样的:

所以这位“病毒猎手”同志,

大概也许可能打开了搜索引擎,

随手输入关键词“BA.4”,

搜出来了Haseltine老爷的福布斯专栏,

然后原样搬运了Haseltine老爷的翻车文章,

并借题发挥,好一顿虚空输出……


这位“病毒猎手”同志,

这样搞是不行的啦,

Haseltine老爷虽然曾经是真大佬,

但他毕竟已经退居二线好多年了~

福布斯那个专栏,只是他退休之后自娱自乐的个人博客而已,

搬运之前好歹做一做fact check可好?


总之,这位“病毒猎手”同志号称“学术前沿触手可及”的东西,错误还挺不少~

改天有空咱们做个短文改错取乐吧。

今天暂时点到为止,

咱们继续八卦BA.4和BA.5。




BA.4和BA.5的焦虑点有四个。


首先,之前简单提到过一嘴,

BA.1到BA.5一共五兄弟,外加上面Haseltine老师抢跑翻车的那个暂时没拿到命名的,

整整6个分支,全都来源于同一个MRCA(最近共同祖先),

大佬们跑Beast的结果显示,

BA.1和BA.2大概9月份分家,

BA.3稍晚,

BA.4更是晚到了2022年1月份。

这说明了啥?

这说明了那个不知道是免疫缺陷人类还是未知动物的神秘宿主,

他/她/它至少从9月份到1月份的小半年时间里,一直在制造外溢。

光是有蛛丝马迹的,就已经外溢了六次。

这尼玛谁受得了……

万一这位神秘宿主他/她/它还没消停咋办?

万一以后还会陆续冒出来BA.6/8/9/9/N咋办?


然后,之前咱还是简单提到过一嘴,

BA.4和BA.5刺突蛋白RBD结构域的那三个突变——L452R、F486V和R493Q,

拿Bloom老师的Deep Mutation Scanning数据库一查便知,

这仨的功效几乎可以肯定是针对BA.1和BA.2的免疫逃逸。

所以问题就来了,

如果上一条假设成立——BA.4和BA.5是在某个神秘宿主体内持续憋大招的产物,

那么照理说它们应该是处于一种与世隔绝的闭关修炼状态,

不太应该对外界的immunity landscape有如此针对性的变异才对——毕竟,F486V和R493Q可都不是啥常见的突变,

要说这是巧合,打死咱都不信……

所以,最合理的解释有两条:

  • 第一,这位神秘的宿主,他/她/它一边在体内养蛊,一边还跟外界的immunity landscape互通有无,以至于可以针对1月份那阵的流行株搞针对性培养;

  • 第二,这位神秘的宿主,他/她/它持续不停地在制造溢出事件,只是刚好带有刺突蛋白L452R/F486V/R493Q组合的溢出病毒对当前的landscape最为适应,形成了持续感染链,所以才被南非目前极为拉胯的测序体系捕获~

(是的各位你们没看错,Omicron面世之后,南非似乎被全球禁运搞怕了,测序已经远不如当初那么积极了……)


接下来,之前咱又简单提到过一嘴,

Omicron大家族最近掀起了一股轰轰烈烈的趋同演化热潮……

而这一波趋同演化的主角,正是BA.4/BA.5都有的L452。

除了BA.4/BA.5之外,

现如今市面上额外多出S:L452的Omicron家族最新成员还包括:

BA.2.9.1:英国特产,特征定义突变S:L452M(以及其他9个保守突变);

BA.2.11:法国特产,特征定义突变S:L452R(以及其他1个ORF1ab突变);

BA.2.12.1:北美特产,特征定义突变为S:L452Q(以及S:S704L);

BA.2.13:比利时/荷兰特产,特征定义突变S:L452M(以及其他1个沉默突变)。


以上Omicron子毒株的共同特点是——流行率都在疯涨。

特别是BA.2.12.1,正在席卷纽约城~


——请品鉴:

所以BA.2.12.1在美国相对于BA.2的增长率高达75%可还行?

所以问题又来了:

按说应该是起源于关门养蛊的BA.4和BA.5,

到底是为啥如此紧贴时事,

跟一大堆侄子辈打成一片,搞起了亲密无间的趋同演化??


最后,终于有一点之前没提到过的了……

当初及时发现Omicron并向全世界发出预警的那个南非,

已经再也不存在了……

现如今的BA.4和BA.5,

是业余爱好者闲着没事儿翻GISAID玩儿翻出来的,

而正主儿Tulio老师则(又)在开开心心度假……

于是BA.4和BA.5刚刚面世,统发生树就已经枝繁叶茂~


——请品鉴:


如上图,

BA.4和BA.5刚刚被发现,

就已经各自外溢多个国家/地区,

并各自拥有两个地理分隔明显的分支,

这就好比是,

刚刚查出癌症,就已然三期甚至四期~

……

……

没办法啦,这就是躺平的代价。




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