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[境外疫情观察] 南非,第五波,爆发前夜

拍老师 拍照稀烂的焦虑怪 2022-05-21


前言

大家晚上好,正如标题所述,南非又双叒叕爆了~(或者确切地说,马上就要开爆)并且又双叒叕一次引领全球潮流,率先完成了流行株交替。正在全球绝大多数地区肆虐的一代魔王BA.2,已然被拍死在南非的沙滩上,可见这地方水有多深,内卷有多猛……

总之,推动本次爆发的后浪是刚刚在全球其他地方露头的Omicron家族最新成员:BA.4 & BA.5
下面咱们就来简单品鉴品鉴。




话说,两年时间经历四波大爆发之后,

南非人已然积累了丰富的爆发经验,

为了精准地辨别大爆发和小波动,

他们甚至设计了一个严谨的判定标准~


——请品鉴:

如上图所示,按照SACMC的定义,

需要单日新增确诊人数(七日滚动均值)超过上一波波峰的30%时,

才能正式宣布进入新一波大爆发,

如果按照这个标准的话,

南非这第五波,其实还得再等两天才正式开张,

不过呢,毕竟咱们都是见过世面的,

咱们从倍增时间、有效再生数、检测阳性率等全方位多角度来盲猜,

都不难看出:

这第五波,差不多算得上板上钉钉了已经~

而这一波,正如前言所说,

将是全球首个把BA.2拍死在沙滩上的一波~

壮哉我大南非,又一次领跑全球~

这养蛊实力,竟恐怖如斯!




下面直接进入飙图模式了啊~


——首先是PCR检测人数(七日滚动均值,下同),请品鉴:

所以从2月份开始,一直到4月中旬,南非的检测力度一路滑水到了2020年八九月份的低谷水平,直到最近才开始抬头~不过也难怪,毕竟已经官宣大流行结束了,还有啥检测的必要?
——作为对于,检测阳性率,请再品鉴:

如上图,橙色曲线=单日检测阳性率,蓝色曲线=七日滚动均值。
不管哪根曲线,上周都已然突破20%大关
——再来看看各省份新增确诊情况:

如上图(新增确诊七日滚动均值,小心坐标系魔法),BA.4肆虐的豪登省(黄色曲线)和BA.5肆虐的夸祖鲁纳塔尔省(黑色曲线),毫不意外地再次领先~
——有效再生数:

如上图,南非每一个省的有效再生数都跨越了生死线,
并且除了东西开普之外,其他甚至已经破了1.5大关……

——换个视角:

如上图,南非全国的新增确诊周环比涨幅差不多是120%,或者说新增确诊倍增时间为6天左右~


——元芳!拿放大镜来:

让咱们聚焦豪登省(为啥又是豪登省……),这张图可能不太直观,咱简单解释一嘴:
  • 简单来说,这个是每一波爆发的对比图;

  • 其中黑色曲线=第一波(原始株)、浅蓝色曲线=第二波(Beta)、深蓝色=第三波(Delta)、紫色=第四波(BA.1),红色=即将开张的第五波(BA.4&BA.5);

  • 照惯例,纵坐标是新增确诊人数七日滚动均值;

  • 横坐标则是每一波的持续时间。


或者说,具体而言:

现如今豪登省的新增确诊人数已经达到每百万人每天13.4例;

新增确诊人数周环比涨幅高达173%;

新增确诊人数倍增时间约为4.8天。


再或者说,翻译成人话就是第五波,已经注定了。


——哦对了,还有张图:

以上分别是豪登省和夸祖鲁纳塔尔省的新冠入院情况,

其中红色柱子是2022年以来每周住院人数,黄色曲线则是周环比变化。






上面咱一直在说,南非这波爆发的背后元凶是BA.4和BA.5,

那么具体是怎么一个情况呢?

让我们搬运一下Tulio老师团队的最新预印本呗。


——请品鉴:

标题翻译成人话:

Omicron变异株在南非的不断出现和持续演化:BA.4与BA.5


——Abstract:

继续翻译成人话:

南非(去年11月份开始的)第四波,背后的流行毒株分别是BA.1、BA.2以及少量BA.3;第四波刚刚爆完三个月,BA.4和BA.5又冒出来了……
BA.4和BA.5刺突蛋白部分完全一样。相对于BA.2来说,多出了69/70缺失突变、L452R、F486V,以及R493Q(回复突变);目测,在南非,BA.4相对于BA.2的增长优势为8%每天;BA.5相对BA.2的增长优势则为12%每天。


——突变列表(红色为BA.4/BA.5特征定义突变):


——贝叶斯系统发育树:

如上图,横坐标是时间,

浅黄色分支=BA.4;

泥巴色分支=BA.5;

深蓝色分支=BA.2;

紫色=还没被揪出来的Omicron家族神秘祖先……

按照Tulio老师的说法,BA.4和BA.5大约诞生于2021年12月中旬到2022年1月上旬期间

或者换句话说,BA.4和BA.5整整在南非隐匿传播了三个多月……


——传播轨迹:

如上图,小圆点的颜色代表了测序时间,

线条则代表流行病学传播轨迹。

简单来说,BA.4和BA.5都起源于豪登省~

(又是豪登省!!!)

但BA.5于2022年2月上旬传播到了夸祖鲁纳塔尔省,并在那边站稳了脚跟,实现了多点开花~


——长江后浪推前浪示意图:

如上图,绿色=Delta、紫红色=BA.1、浅紫色=BA.1.1、深紫色=BA.3、蓝色=BA.2、狗屎黄=BA.4、橙色=BA.5……

这一浪接一浪的,可以说是非常真实了


有诗为证:

一波还未平息 

一波又来侵袭 

茫茫人海狂风暴雨 

一波还来不及 

一波早就过去 

一生一世如梦初醒 

深深太平洋底深深伤心




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