查看原文
其他

[例行抢跑] 巴塞尔报告(第三期,2022年8月19日)

拍老师 拍帮主 2022-10-06

前言

各位早上好中午好下午好晚上好~传说中每两周一期的瑞士内参,又登场啦!(上期回顾:《巴塞尔报告(第二期)》

——请品鉴:↑ 直接从github扒下来,格式都还没调整的新鲜货可还行……
总之,鉴于这份内参更新还挺稳定,抢跑速度也够快(Pango委员会内部成员自编自导),干脆后咱就直接拿这货来作为定期变异株现状报告了吧。


第一部分,带有刺突蛋白R346T突变的变异株们

  • (在当前的免疫背景下)刺突蛋白R346T突变可以给BA.4/BA.5带来明显的相对增长优势,预计在10月份,带有这一突变的子毒株们将成为(BA.4/BA.5分支下的)主流毒株;

  • 截止目前,带有刺突蛋白346位点突变的BA.4/BA.5子毒株包括:

  • BA.4.6 (R346T)

  • BA.4.1.8 (R346T)

  • BA.4.7 (R346S)

  • BF.7 (R346T)

  • BF.11 (R346T)

  • BF.13 (R346S)

  • BE.1.2 (R346T)

  • BA.5.9 (R346I)

  • BA.4.6目前测序记录绝对数量最多,但相对于BA.5分支下带有同样刺突蛋白346位点突变的子毒株而言,BA.4.6没有相对增长优势。这应该是由于BA.5本身比BA.4适应性更高;

  • 全球范围内,BA.5分支下带有刺突蛋白346位点突变的子毒株群将于9月份之前在绝对数量上超过BA.4.6。


——请品鉴:

↑ 两者相对增长率对比
拍老师的画外音:关于不同子毒株独立演化出同一突变的解释,请参考:《原罪(第七集)》
拍老师的画外音2:咱敢豪赌5卢布啊!,上述BA.4.6和BA.5徒子徒孙之间的竞争,多半只是茶壶里的风暴而已,到了10月份,它俩大概率会被双双拍死在沙滩上……


第二部分,BA.2.75已制霸印度,并快速开枝散叶

  • BA.2.75已于7月下旬在印度一桶浆糊,并把BA.5拍死在了沙滩上;
  • 其他于8月初之前BA.2.75流行率高于1%的国家/地区包括:
  • 尼泊尔(>50%)

  • 新加坡(~10%)

  • 土澳(~2%)

  • 日本(~1%)

  • BA.2.75主要在亚洲和大洋洲流行率较高,但在其他地区同样表现出了增长趋势,只不过由于绝对数量较少,暂时没法确认具体的增速;
——请品鉴(可能需要点开大图):↑ 从左到右从上到下分别是印度、新加坡、土澳、日本、美帝、德国、英国和以色列的BA.2.75流行率走势。


第三部分,BA.2.75正在快速获得额外的刺突蛋白突变

  • BA.2.75测序记录已经超过3000条,并已表现出明显的内部多样性——然而由于印度测序质量拉胯,Pango委员会暂时只命名了一种子毒株,即BA.2.75.1(带有额外的刺突蛋白D574V突变);
  • 值得留意的额外刺突蛋白突变包括R346T、K356T(占比~1%)、L452R、F486S(已命名)等(拍老师的画外音:还包括F490S、S494P等等……)
  • 由于BA.2.75和BA.5都在快速获得额外的刺突蛋白突变,所以现在还没法确定欧洲秋冬的爆发将会由哪一个分支主导。


拍老师的画外音1:就在今天下午,BA.2.75.2也正式命名了,带有额外的刺突蛋白R346T+F486S,怎么样,这造型,阴不阴间?
拍老师的画外音2:虽然不知道由哪个分支主导,但Cornelius小哥已经确定欧洲秋冬季还要爆一波了……
拍老师的画外音3:之前咱这边提到过一嘴BA.2.75快速获得额外刺突蛋白的原因,请见:《BA.2.75,蓄势待发》

——请品鉴:


第四部分,BA.5和BA.2.75以外的其他阴间毒株

  • 在上一期之后,市面上又冒出了一些阴间变异株……包括:BA.2.10.4、BA.2.38.2、BA.2.38.3,以及……
  • 造型最最最阴间的,BJ.1;
  • 以上新毒株,绝对数量都还很少,暂时无法确定能否对BA.5和BA.2.75构成威胁。

——请品鉴:
拍老师的画外音:以上全是印度特产……
拍老师的画外音2:那么其他地方有没有牛鼻的阴间变异株呢?下面请欣赏俄罗斯代表队的表演~
——请品鉴:
以上!



如需留言评论,请移步后花园:





另外,本人知识星球正式开通:


您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存