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科学研究

Cell 发表后引发的争议:相关工作的预印本是否要引用?

摸鱼的小汪 小汪Waud 2023-06-12
全文共 1655 字,预计阅读时间5 分钟。

本月 8 号,中国科学院遗传与发育生物学研究所周俭民、陈宇航老师团队合作在Cell 上发表文章 WeiTsing, a pericycle-expressed ion channel, safeguards the stele to confer clubroot resistance,近期很多公众号进行了报道(点击深色加粗文字即可跳转链接)。

小柯生命:《细胞》:以“卫青”之名,抵御“绝症”根肿病

有意思的是,该工作似乎引起了一些小争议,前几天易刊植物科学专门出了一期推文讲此事。有一点需要纠正的该争议涉及到的 preprint 的共同一作是 Edel 教授的博后。

本着学习吃瓜的目的,让我们来看看此事~

1时间线

23 年 6 月 8 号,文章正式上线 Cell

北京时间 6 月 9 号,丁平涛老师转发文章相关推文宣传。

Dinglab: www.thedinglab.com
丁老师谷歌学术界面

6 分钟后,来自Université Laval的Edel Pérez-López教授在该推文下评论:“确实是很好的工作,但这个基因(RPB1)之前(202207发在 bioRxiv 上)已经描述过了,作者压根没提。尽管 Cell 的工作做的更加深入,问题是bioRxiv 还重要吗?”

根据公开信息,Cell 收到 Manuscript 的时间是 2022 年 11 月 10 号,而预印本发表的时间是 2022 年 10 月 7 日,早于周老师团队 1 月零 3 天,周老师的这篇文章有没有预先报告/上传到其他地方我们不得而知,但小柯生命的文章中提到这项研究前后花费了7年时间。

投稿于 November 10,2022
发表于 October 07,2022

随后,Edel Pérez-López 教授系统梳理了该基因从 1997 年至今的发展,并表明他承认是非常棒的突破,但该基因近二十年的发展应该被提出来,因此他已经联系了 Cell

Edel教授提供的链接

丁老师礼貌的回复堪称典范!受教了!

2bioRxiv 是否应该被引用?

答案是肯定的!大佬 Sophien Kamoun 也发推回应此事。

bioRxiv(发音为“bioarchive”)是一个免费的在线档案和分发服务,用于生命科学中未发表的预印本。它由冷泉港实验室运营,这是一家非营利的研究和教育机构。通过在bioRxiv上发布预印本,作者可以立即向科学界提供他们的发现,并在稿件提交给期刊之前收到稿件草稿的反馈。文章在发布到网上之前没有经过同行评审、编辑或排版,但会筛除非科学的内容。

虽然各期刊在是否将预印本包括在参考文献部分上没有普遍标准,且在不同学科之间存在差异,但生命科学领域的大多数期刊接受在其出版物的参考文献清单中引用预印本。具体引用方法和关于是否引用的讨论可以查看文章 Giving credit where credit is due: how to cite preprints

https://asapbio.org/how-to-cite-preprints

根据我的观察,国内的课题组和研究生很少有关注 bioRxiv 上的预印本,对于绝大多数研究生来说,没有足够的学识来判断 preprint 文章水平可能是大家不关注它的主要原因。 尽管不能仅凭 IF 和分区评判一篇文章的好坏,但发表到期刊上的文章确实使研究生更便利地学习相关内容。

我认为 bioRxiv 是有利于成果的传播与学术交流的,平时也会关注相关领域的预印本文章。我们课题组在正式发表文章之前(可能处于审稿阶段),也会发表在 bioRxiv 上。

除此之外,万一看到自己的课题被人家发表了 bioRxiv,是不是还有机会联系一下背靠背发表?

3其他

另外,终于看到国产大文章把数据传到 NGDC(National Genomics Data Center) 的 GSA 上了!

两年前第一次看到鲍一明老师在全国植物生物学大会上介绍 NGDC,也比较近距离的感受到了其建设的艰辛,从 99 年6 月郝柏林院士《建议尽快组件国家级的生物医学信息中心》至今, 24 年了,国产数据信息中心的发展离不开自己人的支持!

不管怎样,这项研究都是一个非常漂亮的工作,祝贺!

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