数据惊艳！华大时空组学海外应用案例分享 | 精华回顾
作为全球领先、能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术，华大Stereo-Seq时空组学技术可以全面应用于器官结构，生命发育、生命演化、人类疾病等重大问题研究，推动生命科学和医学领域的发展，带来生命科学领域第三次科技革命。
目前，华大时空组学技术已积极参与多项国家级大科学计划、大科学工程，同时在海外也有诸多应用。近日，基因组学行业创新大会-生命时空组学论坛圆满落幕。来自牛津大学的Katherine Bull博士和瑞典卡罗林斯卡医学院的Rickard Sandberg教授，就华大时空组学技术和单细胞技术在各自研究中的应用，进行了精彩的专题报告。论坛由深圳华大生命科学研究院欧洲分院执行院长商周春副研究员主持。
报告1
嘉宾：Dr. Katherine Bull
题目：The Cellular Pathology of Autoimmune Kidney Disease
来自牛津大学的Katherine Bull博士，研究领域主要聚焦于解析肾脏疾病的细胞与分子机制以推进新的诊断和治疗方法的开发。本次报告中，Katherine介绍了利用单细胞核测序（snRNA-seq）结合Stereo-seq技术探究狼疮肾炎分子机制。
狼疮肾炎在全球来看发病率较高且预后较差，因此利用多种技术相结合探究其致病机制具有重要临床应用前景。研究中他们使用了药物诱导小鼠模型来模拟狼疮肾炎并用健康小鼠作为对照。肾小球损伤通常伴有免疫复合物沉积，是导致多种慢性肾病发生的主要原因，因此对于肾小球结构及功能解析对于探究狼疮肾炎机理十分重要。利用snRNA-seq，结果显示免疫细胞比例在疾病模型中显著提高。同时结合华大Stereo-seq技术，可以在空间位置上清楚分辨出肾脏中不同细胞类型分布，有效促进了肾小球疾病发展及肾小球与免疫细胞互作等机理的研究，阐明了空间组学和单细胞组学数据在革新肾脏病理研究和应用方面的潜力。
报告二
嘉宾：Prof. Rickard Sandberg
题目：Scalable, cost-efficient plate-base scRNA-seq for improved single-cell analysis of tissues and cellular processes
来自瑞典卡罗林斯卡医学院的Rickard Sandberg教授介绍了他们最新研发的高通量单细胞RNA全长测序技术Smart-seq3xpress。该技术在Smart-seq3的基础上进一步优化了实验流程，可以有效降低单细胞全长转录本测序的建库成本。通过该技术，Sandberg团队仅仅使用少量外周血单核细胞测序便成功的分辨出多种T细胞亚型。而之前T细胞亚型的分辨需要至少10倍的单细胞测序量以及其他实验数据的帮助才可以得到。
另外，Xpress RNA-seq可以实现RNA起始量低至0.5ng，并且全流程在MGISP-960实现自动化。Rickard也高度评价了DNBSEQ-G400（即MGISEQ-2000）在测序数据质量和成本效益方面的优势。
最后，他还分享了人类皮肤图谱计划的最新进展，该计划由Sandberg与Kasper研究团队合作开展，同时结合华大Stereo-seq时空组学技术来构建人类皮肤的单细胞多组学和时空的精细图谱。
| 感谢商周春、安艳茹、梁宁撰稿
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