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为了帮助科研人员更好地利用时空组学技术开展研究，华大时空整理了2021-2022年所测试的近百种组织类型相关信息，汇集成样本测试目录发布。目录内含样本类型、实验参数、测试结果等。研究人员在开展时空实验前可参考该目录，以便高效推进实验。上下滑动图片查看样本测试目录，详情目录请移步华大时空组学官网查看a.

在国家发改委等有关部门的大力支持下，由湖北省人民政府联合中国生物工程学会等18家国家级学（协）会、中国科技报社共同主办、武汉市人民政府承办的“第十五届中国生物产业大会”将于2023年6月9日-12日在湖北武汉·中国光谷科技会展中心举办，其中，“生命时空组学高峰论坛”将于6月9日进行。诚邀您的关注。本届大会以“新格局、新起点，构建生物经济发展新引擎”为主题，举办生物经济高层论坛、专题分论坛、大型专业展览活动，展现生物领域最新发展态势，推进生物经济高质量发展。大会将邀请国家领导人、有关部委负责人、湖北省和武汉市负责人、国内外著名专家等围绕生物产业发展政策与战略、关键领域等发表主题演讲，为国家、地方和行业发展提供指导。近年来，随着时空组学新技术、新工具的不断突破，时空组学领域成果丰硕，为充分展示和交流近年来时空组学领域的成果，助力产业快速发展，武汉华大生命科学研究院将于6月9日在本届大会上举办“生命时空组学高峰论坛”。届时，来自全国科研院所、高校的院士、专家学者和技术达人将齐聚现场，分享讨论时空组学技术应用的机会和挑战，为时空组学技术驱动生命科学创新发展提供前沿视角。报名方式1.

v2.0：图像质控新增对于DAPI染色图像和IF染色图像的QC功能；新增基于DAPI图像的IF图像校准功能；新增IF图像区域识别的阈值式组织分割功能；软件输入输出IPR格式版本升级；SAW

盛夏逐梦自贸港，青春奋进新征程我们是谁浙江大学海南研究院三亚华大生命科学研究院三亚崖州湾科技城你可以得到的和顶尖高校大学生一起学习“玩耍”与浙大、华大优秀顶尖专家教授面对面交流听师兄师姐分享读研经验沙滩Party，感受三亚风情活动时间2023年7月16日-22日活动地点海南省三亚市崖州湾科技城创新研学谷报名对象👫农业、海洋、生命科学、生物医药及其相关专业的2024届全日制优秀本科毕业生，对农业、海洋相关研究方向（包括：农艺与种业、资源利用与植物保护、作物、微生物、园艺、海洋生物与药物、海洋地质与资源、基因组科学、生物信息学等等专业）有浓厚的兴趣，成绩优秀，成绩总排名前20%有机会获得推免资格，有出色的科研成果者学习成绩标准可适当放宽。报名条件👇1.有在校科研项目实践经验或实验室经验，积极参加班级学校的相关科研及社团活动；2.英语水平良好，有较强的听说读写能力；3.良好的学习逻辑思维和科研创新能力。活动安排🙌滑动查看日程安排营员资助本次夏令营住宿免费、提供一定额度餐食补贴、交通补贴报名通道💬1.报名时间：即日起至2023年6月20日；2.网上报名：扫描下方二维码或点击文末阅读全文报名。扫码立即报名👆报名材料✔1.优秀应届本科毕业生夏令营申请表；2.在校成绩单（教务部门盖章）；

肠道微生物与其宿主表现出复杂的相互作用，并在整个生命周期中塑造生物体的免疫系统。脾脏作为最大的次级淋巴器官，是进行免疫应答的重要场所。然而，目前仍不清楚微生物与脾脏相互作用的分子机制以及微生物群对脾脏免疫细胞转录过程的影响。2023年5月6日，Journal

近日，深圳华大生命科学研究院时空团队在预印本平台BioRxiv上发表重磅技术文章《Integrated

项目背景时空转录组技术是近年来发展迅猛的新兴技术，它不仅能够定量检测细胞的基因表达，还能精确定位细胞在组织中的空间位置，实现了从时间、空间维度深度解析健康和疾病状态下细胞类型和基因表达的变化过程。华大时空组学技术Stereo-seq是一项基于DNA纳米球测序芯片自主研发的可实现超高通量、超高精度的全景式时空转录组技术，它将认识生命空间的分辨率提高到了500

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通过迁移学习和空间嵌入进行空间高分辨率转录组数据细胞注释推荐阅读联系我们对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师，可选择以下方式和我们联系，我们将及时为您进行详细的介绍：1.

理解衰老，认知生命。2023中国衰老科学大会（CASC）将于4月21-23日在北京举办。华大生命科学研究院副院长顾颖受邀参会，并就Science封面文章“Single-cell

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自主工具，人人可及。未来，华大时空将持续升级，助力更多的科学新发现。如对华大时空组学高精度3D重构感兴趣，可联系collaboration@stomics.tech进行咨询。参考文献[1]

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。种业是粮食安全的命脉。4

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。生命发育研究是生命科学领域的重要研究方向之一。通过对胚胎发育、神经发育、器官发育等方向进行研究，可以揭示生命发展的奥秘。时空组学技术可以从单细胞分辨率去解析细胞的动态变化，为精确识别细胞内的分子互作和细胞间的互作关系提供了可能，从而为组织、器官的生长发育机制研究提供参考。2022年5月，研究人员利用华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，在国际上首次绘制了小鼠胚胎发育时空图谱，这是迄今为止最高精度最全面的时空基因表达数据集，该研究成果以封面文章形式在Cell发表。2022年9月，研究人员利用Stereo-seq绘制了全球首个蝾螈端脑发育及再生的时空单细胞转录组图谱，鉴定了蝾螈端脑再生过程中的重要神经干细胞亚型，该研究成果以封面文章形式在Science发表。以上研究为深入探索生命发育提供了重要参考。

充足的科研经费支持，国际高水平科研机构和产业合作网络，强大跨学科工作环境以及开放的学术氛围，有机会与国际顶尖实验室及研究团队进行合作推进；3.

华大Stereo-seq助力揭示黑色素瘤细胞的生长和转移机制推荐阅读联系我们对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师，可选择以下方式和我们联系，我们将及时为您进行详细的介绍：1.

时空组学技术作为前沿科研工具，有望推动继显微镜和DNA测序技术以来的生命科学领域第三次科技革命。华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq是一项基于DNA纳米球测序芯片自主研发的可实现超高通量、超高精度的全景式时空转录组技术，它将认识生命空间的分辨率提高到了500

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健康是幸福之源，强国之基。3月18日，由中国妇幼保健协会主办的“第十八届国际基因组学大会：生育健康临床应用”(ICG18·RH)在杭州召开。海内外妇幼健康领域专家齐聚一堂，共同探讨妇幼健康新发展和新未来。同时，大会现场启动了杭州市“时空组学英才计划”，以期赋能杭州前沿科技临床应用转化与人才队伍建设。本次大会由中国妇幼保健协会主办，杭州市卫生健康委员会指导，浙江大学医学院附属妇产科医院和华大基因共同承办。会议通过线下会议结合网络直播的形式召开，海内外三十余位妇幼健康领域权威专家以“全周期全覆盖，守护妇幼健康；大民生多组学，科技造福百姓”为主题，聚焦全球出生缺陷防控领域的热点和难点，就孕/产前筛查与诊断、遗传病诊疗技术等领域，围绕时空组学技术、出生缺陷三级防控展开专题演讲和学术研讨，分享临床应用的经验成果，共同推动预防出生缺陷防控关口前移，携手共助我国出生缺陷防控事业高质量发展。时空组学与精准医学专题报告时空组学技术作为前沿的科研工具，有望推动继显微镜和DNA测序技术以来的生命科学领域第三次科技革命。华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq是一项基于DNA纳米球测序芯片自主研发的可实现超高通量、超高精度的全景式时空转录组技术，它将认识生命空间的分辨率提高到了500

时空组学技术作为前沿的细胞研究工具，能为研究者提供时间及空间两个维度的信息。华大时空组学技术Stereo-seq是一项基于DNA纳米球测序芯片自主研发、可实现超高通量和超高精度的全景式时空转录组技术，它将认识生命空间的分辨率提高到了500

为践行健康中国行动，实现全民健康的大目标，由中国妇幼保健协会主办的“第十八届国际基因组学大会：生育健康临床应用”(ICG18·RH)

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。《时空云课堂》汇聚了华大时空举办的线上研讨会、产品使用指南、技术培训课等视频资源，以期助力科研工作者深入开展时空领域的研究探索。敬请关注。单细胞组学技术的日趋成熟和时空组学技术的不断突破使二者成为解读生命密码的重要工具，在器官结构、发育、人类疾病、生命演化等领域的研究中发挥着重要作用。在单细胞和时空组学数据处理中，精准的细胞分割和细胞类型注释是其中的关键环节，需要借助强大的工具和方法将图像信息与外部数据集相结合，以提高图像分割，从而提高单细胞和时空组学技术的整体准确性。本期《时空云课堂》为大家带来“时空组学生信分析工具的研发与应用”研讨会回放。4位海内外专家分享单细胞和时空组学生信工具研究中的前沿成果，欢迎各位老师观看。

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。近期，来自以色列魏茨曼科学研究所的研究人员概述了针对mRNA的空间检测方法（空间转录组学）和基于抗体的原位蛋白质检测方法（蛋白质组学）两类主要的空间分析技术，介绍了这些技术可以获取的信息类型，并描述了它们在癌症研究中的应用、发现和挑战。此外，就如何将空间分析信息整合到癌症研究中，以改善患者诊断、预后、治疗分层和新疗法的发展进行了讨论。该综述发表于2023年2月Cancer

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。来自美国加州理工学院的研究人员开发了一种高度灵敏的空间转录组学技术——高灵敏序贯荧光原位杂交（ultrasensitive，sequential

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。《时空零距离》是华大时空推出的聚焦时空组学技术的栏目，将不定期邀请生命科学领域的学术大咖、科研作者、技术达人进行访谈分享，内容涵盖认知科普、前沿成果、技术进展分析等，为科研工作者创新研究提供多维视角。敬请关注。《时空零距离》第2期。癌症——全球致病和致死最主要原因之一。据世界卫生组织国际癌症研究署（IARC）2021年发布的数据显示，在全球范围内，随着人口老龄化加剧，预计2040年癌症负担将比2020年增加50%，届时新增癌症病例将达到近3000万。被称为“众病之王”的癌症，究竟是如何发生的？人类如何才能战胜它？或许这是尚无法轻易定论的话题，但相信我们不会停止探索答案的脚步。本期《时空零距离》，邀请到来自华大生命科学研究院时空病理专项主任科学家吴靓，为大家简要讲述癌症的起因、检测、治疗等硬核内容，以及时空组学技术对癌症治疗带来的帮助。吴靓华大生命科学研究院时空病理专项主任科学家Q癌症为什么会发生？吴靓：严格来说，癌症不是某一种疾病，它是一类可能影响到身体各个部分的疾病通称。当前癌症的分类主要是根据发生病灶的部位或者器官进行的，最为常见的有乳腺癌、肺癌、结直肠癌、前列腺癌、胃癌、肝癌等。此外，每一种癌症还可以根据肿瘤细胞的来源、分子特征进行进一步的分类，更细致的分类有助于选取最合适有效的治疗方法和手段。如今，随着技术的发展和人们对于癌症认知的不断加深，基于分子特征的分类分型也被广泛接受。癌症起源于正常细胞，其转变为癌细胞是多阶段过程。通常是从癌前病变发展到恶性肿瘤。而这个过程是基因突变累加的过程，这些变化是个人的遗传因素与外部因素相互作用的结果。其中，主要的外部风险因素可以分为三类——物理的有紫外线、电离辐射；化学的有烟草、酒精、黄曲霉毒素等；生物的有病毒、细菌等引起的感染等，比如，99%以上的宫颈癌都是由人乳头瘤病毒HPV持续感染引起的。我们之所以闻“癌”色变，是因为它的典型特征之一是癌细胞能够快速生成，这些异常细胞能够超越其通常边界生长，并且可以侵袭身体的临近部位和扩散到其它器官，也就是转移。Q癌症治疗为何困难？吴靓：目前而言，30%~50%的癌症可以通过避免危险因素和落实现有的预防策略得到预防。此外，很多癌症如果能够及早得到诊断并根据最佳做法进行治疗，患者治愈的可能性很高，比如乳腺癌、宫颈癌、口腔癌和结肠直肠癌等；还有些癌症，如不同类型的儿童白血病和淋巴瘤，如果能够加以适当的治疗，那么即使癌细胞已经扩散到身体其它部位，其治愈率也可以很高。大家对癌症的印象通常是治疗复杂、困难，这主要是因为很多患者在初诊的时候就已经是晚期了，这个阶段的治疗手段相对有限，治疗效果相比早期也会差很多。晚期癌症难治疗的原因主要涉及几个方面：晚期癌症大部分已经发生了播散转移，难以手术根除；肿瘤细胞异质性的存在也是药物治疗发生耐药的一个重要因素；此外，人类的免疫系统是控制癌症的法宝，而晚期患者经过癌症的长期侵袭和驯化，其免疫能力和功能也受到了一定的影响。目前，免疫治疗及其联合疗法已在多种癌症治疗中起到了积极的效果，但其治疗有效率的提高仍然面临一些挑战，比如说，具有哪些特征的患者才能从中受益？如何才能增加受益人群？Q癌症检测技术目前存在什么短板？吴靓：今天癌症确诊的方法主要是通过影像学检查结合病理诊断。癌症如能在早期及时诊断并得到适当的治疗，将大大提高癌症患者的存活率。近年来，癌症早期检测是大家在努力的方向，比如目前出现的一系列基于循环肿瘤DNA、细胞、甲基化特征、代谢产物特性等进行的检测，显示了对癌症早期检测的可行性。在这当中，也存在一个非常现实的瓶颈，即我们目前仍然缺乏对早期癌前病变进展预测的理论基础。检测后如何形成有效的解决方案是目前的一大挑战，而这也依托于我们对癌症发展规律与机制的进一步认知。癌症的发生发展是一个时间伴随的过程事件。虽然癌症的本质是一堆不受控制、异常增殖、侵袭、迁移的肿瘤细胞的主体，但它的进展过程并不仅仅是癌细胞单一的“功劳”，其它细胞（包括成纤维细胞、免疫细胞组成的肿瘤微环境）也在扮演着重要的角色。此外，在不同时期，这些细胞组分的对抗和协同共同塑造了癌症进展的不同阶段，其对应的治疗手段也就不同。因此，解析这个规律和特征是我们认知癌症、预防和治疗癌症的理论基础。Q时空组学技术带来了哪些新的可能性？吴靓：在单细胞测序技术出现之前，我们能测量的是一个细胞群体中每个基因的平均表达水平，这不仅忽略了肿瘤细胞的异质性，也无法真实地反映肿瘤环境中各个组分的实际情况。单细胞技术的出现，让我们能够对肿瘤细胞的异质性及环境中各种不同细胞类型都进行很好的剖析。但由于单细胞技术存在细胞空间位置信息缺失的不足，我们对这些细胞之间的互动、相互作用及影响的解读也就无能为力。时空组学技术的出现，很好地解决了这一短板。借助时空组学技术，我们能够清晰地看到细胞和细胞之间的位置关系、状态特征，而这对于我们认识微环境、尤其是细胞间的相互作用是非常重要的。结合对癌症发展不同进展阶段的研究，时空组学技术能够帮助我们更好地理解肿瘤进展的规律，找到影响这些节点的关键细胞类型、特征和调节方式，从而为癌症的诊断、监测及治疗指导提供理论基础和方向。Stereo-seq

Cloud的出现，为充分探索时空组学数据提供了一个领先的数据分析平台，它将大大提高生命科学领域的多组学数据分析效率，加速科研进程，助力科研转化。聚焦数据分析，赋能时空项目STOmics

时空简讯第42期。空间转录组学技术是近年来发展迅速的新兴技术，它能够定量测量细胞的基因表达，追踪细胞在组织空间的精确位置，揭示健康和疾病状态下细胞-细胞相互作用，是生命科学和生物医学领域中重要的技术突破之一。根据如何获取细胞在组织中不同空间位置的信息，该技术主要可分为基于显微切割、原位杂交、原位测序和微阵列技术等类型。为快速、高效地传播、共享有关空间和单细胞多组学技术的开发及应用，华大时空特推出时空/单细胞技术专题简讯。遴选空间和单细胞多组学新技术开发、技术革新与评测类的代表性文献，持续、针对性地进行精要解读，敬请关注。空间和单细胞多组学技术的发展，能够让我们深入理解健康和疾病状态下细胞的结构与功能。在此，遴选了9篇描述空间转录组技术及其工作原理的优质前沿文章，展示了当前基于不同方法获取细胞空间位置信息的空间转录组学技术进展情况，供了解参考。综述Review空间转录组学技术及其发展方向Nature

spatial-CUT&Tag：细胞水平的空间分辨染色质修饰图谱推荐阅读联系我们对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师，可选择以下方式和我们联系，我们将及时为您进行详细的介绍：1.

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。2月20日，在海南省三亚崖州湾科技城管理局的大力支持下，海南省崖州湾种子实验室与三亚华大生命科学研究院联合“揭榜挂帅”项目启动仪式暨研讨会在崖州湾科技城种子实验室顺利举办。此次签约启动的5个项目主要围绕水稻、大豆等作物进行科研攻关，助力我国种业研究开创新篇章。中国工程院院士盖钧镒，华大集团董事长、联合创始人汪建，崖州湾种子实验室执行主任、中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员陈凡，山东农业大学作物生物学国家重点实验室主任、教授张宪省，浙江大学生命科学学院教授、澳大利亚科学院院士James

因微信公众号改版，各位老师可将“华大时空”标星🌟，以便及时查看时空组学前沿动态。ChatGPT，当前AI届最红炸子鸡，上线2个月一路狂飙斩获1亿用户。作为AIGC（生成式人工智能）的重要突破，他已在传媒、电商、影视等行业大展身手，高效地进行新闻，脚本等内容输出，大有取代UGC创作之势。就生命科学领域而言，尽管ChatGPT无法直接参与到科研进程中，但是其背后的AI技术，与生命科学碰撞会带来哪些突破？我们听一听这位六边形战士怎么说。基于GPT进一步开发的自然语言处理模型ChatGPT简单的介绍下你自己？我是OpenAI的一个训练过的大型语言模型，名字叫ChatGPT。我被训练过回答各种各样的问题，从简单的到复杂的，从实际的到虚构的。我的知识截止日期是2021年，所以我不能回答最新的信息。我的目标是尽可能准确和有帮助地回答您的每一个问题。你的出现对从事生命科学的工作者有哪些帮助？作为一种计算机程序，我不能直接参与生命科学的实际研究和应用，但是我可以为生命科学相关的问题提供信息和帮助。比如，我可以：提供生物学术语的定义和解释；回答生物学相关的问题，例如生物体的特征，生物进化的原理，疾病的病因和治疗方法等；帮助生命科学研究人员筛选和检索相关的文献；帮助生命科学研究人员了解最新的生命科学研究进展。总的来说，我的出现可以帮助生命科学研究人员更快、更准确地获取信息，从而推动生命科学的发展。那你听说过Nature

2月8日，由健康报社组织评选的2022年度中国十大医学科技新闻和国际十大医学科技新闻揭晓。华大主导完成的“非人灵长类动物全细胞图谱发布”入选中国十大医学科技新闻，同时入选的还有基因治疗血友病获新突破、新冠病毒趋同进化趋势获揭示等。本次入选的非人灵长类动物全细胞图谱，由深圳华大生命科学研究院主导、多国科研团队共同完成，于2022年4月13日在国际顶级学术期刊Nature发表。研究团队基于华大自主开发的单细胞建库和测序平台，对成年猕猴的45个组织或器官约114万个细胞进行单细胞测序分析，将其分成了113种主要的细胞类型和463种细胞亚类，构建了全球首个非人灵长类动物的全身器官细胞图谱。该图谱将被用于物种进化、人类疾病以及药物评价和筛选相关的研究，有望为生物医学的发展提供基础性的资源和工具。非人灵长类动物相比其他动物，在人类疾病特别是认知和神经系统疾病研究中具有显著优势。利用非人灵长类细胞图谱，可找到各个组织的共有细胞类型及其特异性标记基因，为了解这些共有细胞在不同组织里发挥功能提供分子层面证据。自2016年起，健康报社已连续7年组织了十大医学科技新闻评选。本次医学科技新闻评选采用数据检索和专家学者讨论评议相结合的方式，设置初筛、初评和终评环节。来自基础医学、临床医学、公共卫生、中医药、药学等领域的专家学者共同担任评选顾问。评选顾问对该成果的推荐理由为，猕猴全细胞图谱的绘制，能够为人类疾病机制和临床前研究提供丰富的信息，开拓新的视野，为更好地认识生命的基本结构，探究疾病和细胞的关系打下了基础，也为疾病精准治疗提供了新的方向。论文的共同通讯作者之一、华大生命科学研究院院长徐讯表示：“大规模细胞图谱的绘制工作，对于我们理解器官结构组成、胚胎发育和衰老、人类疾病及生命演化等都具有重要的意义。未来，我们还将开发更高通量的单细胞技术以及具备空间分辨率的多组学技术，为全面构建生命单细胞分辨率的时空图谱提供重要工具。”除了全球首个非人灵长类动物全细胞图谱外，2022年，华大凭借在单细胞测序技术和时空组学技术两个核心工具上的突破，先后主导完成全能性8细胞期胚胎样细胞研究、全球首批生命时空图谱、全球首个蝾螈脑再生时空图谱，研究成果分别登上国际三大顶级学术期刊Nature、Cell、Science。

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癌症，众病之王。从希波克拉底和盖伦的体液学说时代的放血治疗到解剖学麻醉技术发展推动的手术治疗，从发现X射线开启的放射治疗到破解DNA双螺旋结构解锁的靶向药物治疗，再到当前的细胞免疫治疗，人类在认识癌症、对抗癌症的4000多年中，由表及里，不断深入。为了帮助更多科研工作者深入了解癌症前沿研究进展，在

并量化了治疗时间点肿瘤富集区域内CD45阳性细胞的百分比，以探究DSP测量是否与传统IHC测量相关（图6a）。研究人员发现，来自DSP的富含Pan-CK的CD45测量值与CD45

mg/dL以下；移植后第12周，平均糖化血红蛋白从基线7.7%±2.2%降至4.3%±1.3%（达到健康恒河猕猴水平），同时，外源性胰岛素需求急剧下降，从2.3±0.5

病理学是一门研究疾病病因、发病机制、发展规律，以及疾病过程中机体的形态结构、功能代谢变化和病变转归的医学基础学科。因此，病理学一直被视为基础医学与临床医学之间的“桥梁学科”，在医学中具有不可替代的重要作用。现代医学之父William

病理的精准诊断，离不开新技术的建立和应用。近两年，生命科学领域最重要的技术突破之一——时空组学，实现了生命在时间和空间维度上细胞“地图”的全面绘制，大大推动了我们对于生命复杂性，尤其是人类疾病的全面认知。正如近期发表在国际期刊Life

今日，中国科协生命科学学会联合体公布2022年度“中国生命科学十大进展”，华大生命科学研究院主导完成的“高精度生命全景时空基因表达地图绘制”入选。本次入选的华大科研项目由中国生物工程学会推荐评选，同时入围的还有“新冠病毒突变株免疫逃逸机制”等项目。图片来源：中国科协生命科学学会联合体官网为推动生命科学领域的创新发展，中国科协生命科学学会联合体以“公平、公正、公开”为原则开展年度“中国生命科学十大进展”评选，通过组织成员学会推荐，基础生命科学、生物技术和临床医学等领域同行资深专家评选，经中国科协生命科学学会联合体主席团审核后最终确定。此前，华大参与的“脊椎动物从水生到陆生演化的遗传创新机制”项目入选2021年度“中国生命科学十大进展”。本年度入选的“高精度生命全景时空基因表达地图绘制”项目的系列研究成果由华大生命科学研究院联合中科院、南方科技大学、华中农业大学及广东省人民医院等团队完成。研究团队基于华大自主研发的时空组学技术Stereo-seq，在国际上首次绘制了小鼠、果蝇、斑马鱼、拟南芥等重要模式生物迄今为止最高精度、最全面的时空基因表达数据集，并构建了全球首个高分辨率蝾螈脑再生时空图谱，发现了过程中起关键调控作用的全新细胞类型。华大时空组学技术Stereo-seq基于自主DNA纳米球测序技术研发而成，是一项同时具备高精度、大视场的空间转录组技术，将认识生命的分辨率推进到了500nm的亚细胞尺度，相比过去同类技术，分辨率提升了200倍。“高精度生命全景时空基因表达地图绘制”系列成果中，小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱，首次从时间和空间维度上对生命发育过程中的基因和细胞变化过程进行超高精度解析，为认知器官结构、生命发育、人类疾病和物种演化提供全新方向。2022年5月4日，Cell出版社官网以时空组学联盟（STOC）专题的形式发布了该系列研究成果。之后，小鼠胚胎发育时空图谱相关成果更是以封面文章的形式在《细胞》（Cell）期刊发表，斑马鱼、果蝇、拟南芥时空图谱相关成果以封面文章的形式在《细胞》子刊《发育细胞》（Developmental

时空简讯第39期。乳腺腺体是乳房最重要的结构之一，具有分泌乳汁、哺育后代的功能。但同时，各种乳腺疾病，如乳腺炎、乳腺增生、乳腺纤维瘤、乳腺囊肿、乳腺癌，也是当下危害女性身心健康的主要疾病之一。根据《2022中国女性乳腺健康粉红报告》显示，我国每年新增乳腺癌患者约42万人，平均每76秒就有1例确诊，已成为中国女性高发恶性肿瘤之一，且发病人群逐步年轻化。乳腺癌作为女性健康的“头号杀手”，让众多女性“闻之色变”。其实，乳腺癌并没有想象中那么可怕，做到“早预防、早发现、早治疗”，能够极大地提高乳腺癌的治愈率和生存率。在此，我们遴选了有关乳腺癌的进展机制、治疗策略及研究工具等9篇前沿文章，展示了空间及单细胞组学技术在乳腺癌病理与诊疗方面取得的最新成果，供了解参考。病理机制Pathological

Resolution”主题报告，与您分享时空组学技术Stereo-Seq为创新性植物研究提供前所未有的研究思路和解决方案。会议特邀报告报告人Shan

1月13日，深圳特区报对“人类时空组学”大科学计划发展进程进行了特别报道，以下是详细内容。深圳特区报对“人类时空组学”大科学计划进行报道“时空组学技术的出现，实现了生命在时间和空间维度上细胞‘地图’的全面绘制，这将大大推动我们对于生命复杂性和人类疾病的全面认知。”日前，华大生命科学研究院院长徐讯表示，在深圳大科学计划管理机制下，深圳科研团队整合各方优质创新资源，发起“人类时空组学”国际大科学计划近期取得重大进展，为深化国际科技合作交流、解决基础前沿领域的世界性重大科学问题贡献了深圳智慧。深圳积极探索大科学计划国际大科学或工程项目是人类开拓知识前沿、探索未知世界和解决重大全球性问题的重要手段，也是一个国家综合实力和科技创新竞争力的重要体现。比如国际综合大洋钻探计划，1968年由美国等多个国家启动的深海钻探计划及后续的国际大洋钻探计划、综合大洋钻探计划和正在实施的国际大洋发现计划，是地球科学领域内迄今规模最大、影响最深、历时最久的大型国际合作研究计划，我国于1998年加入该计划。半个世纪以来，研究人员共完成钻井3000余口，累积取芯超过40万米。研究成果验证了海底扩张和板块构造理论，发现了海底“深部生物圈”和“可燃冰”，引起了整个地球科学领域的革命。人类基因组计划与“阿波罗登月计划”和“曼哈顿原子弹计划”并称为20世纪自然科学领域的三大“大科学工程”。1999年，华大代表中国参与“人类基因组计划”这一规模宏大、跨国跨学科的科学探索工程而诞生。中国承担了“人类基因组计划”1%的测序任务。2003年4月13日，六国联合发布了《关于完成人类基因组序列图的联合声明》。这标志着历经13年时间，耗费38亿美元的人类基因组计划正式完成。人类基因组计划的完成，标志着生命科学新时代的开始。在这个过程中建立起来的基因组学、生物信息学技术，对生物相关学科和产业的发展起到了巨大的推动作用，有关生命科学的新兴技术和生物产业如雨后春笋般涌现，而中国的基因测序技术也从追赶到并跑，再到逐步走向引领。“过去国际大科学计划主要由欧美日等国发起，我国科学家在其中发挥的牵头作用还不足。”徐讯表示，要改变该局面，需要大力发挥我国硬核科技力量，并作为基础设施投入到大科学计划中，使得中国真正成为大科学计划中不可或缺的部分。2018年3月，国务院印发《积极牵头组织国际大科学计划和大科学工程方案》，为做好国际大科学计划和大科学工程的组织实施工作进行具体部署。随着深圳市进入“双区”叠加的发展黄金时期，牵头发起或参与国际大科学计划和大科学工程，是深圳市建设具有全球影响力的科技创新中心的必要举措。“以深圳综合改革试点为契机，深圳着力完善工作机制，积极探索大科学计划的发起、组织、建设、运行、管理等机制，为聚集全球优势科技资源、扩大深圳国际科技影响力提供重要支撑。”市科创委相关负责人介绍，深圳印发《大科学计划推进工作方案》，改革完善了大科学计划推进工作机制，明确操作规范和实施路径，按照“以我为主、前瞻布局、分步推进、量力而行”的整体思路，依托已布局建设的大机构、大平台、大设施一体推进大科学计划实施，支持包括深圳华大生命科学研究院牵头发起“人类时空组学”大科学计划，推动一批大科学计划加快实施。相关经验做法于2022年10月获国家发改委向全国推广。“人类时空组学”大科学计划推出“时空组学”是近两年生命科学领域最重要的技术突破之一。徐讯表示，该技术可以实现在时间和空间尺度对组织器官进行原位测序，从而直接获得能反映生命原貌的分子图谱，是绘制高精度“生命地图”的基础工具。2022年5月，华大主导成立了“时空组学国际联盟”，目前已有来自30个国家，190多个领域知名团队参与。时空组学联盟成立仪式目前，时空组学联盟已开展了超百项时空组学项目，首批成果在《细胞》、《科学》等杂志以专辑形式发表。Cell出版社官网以时空组学联盟（STOC）专题的形式发布了全球首批生命时空图谱“在此基础上开展人类时空组学国际大科学计划时机已经成熟。”华大生命科学研究院首席科学家刘龙奇表示，“人类时空组学”国际大科学计划，将时空组学新技术全面应用于生态多样性、生命演化、生命系统发育、人类疾病等重大生命科学和医学问题研究，实现自达尔文进化论、人类基因组计划以来生命科学和医学领域最重大的系统性突破。“推进大科学计划将建立‘共有、共享、共为’管理机制。”市科创委相关负责人表示，深圳借鉴国内外先进经验，强调既充分发挥牵头发起人和发起单位的主体作用，也注重整合各方资源共同参与。“华大是深圳大科学计划管理机制下的受益机构。”刘龙奇表示，深圳华大生命科学研究院牵头发起的“人类时空组学”大科学计划，联合全球不同国家的顶级科研机构，以时空组学源头性、颠覆性技术为支撑，共同制定技术路线和质控标准，共同制定数据的存储和计算的架构和方案，围绕人类器官时空图谱、人类发育时空图谱、人类疾病时空图谱等重大问题展开大科学研究，做到样本共享、平台共享、技术共享、工具共享、数据共享，推动重新认知生命起源。点击视频了解时空组学联盟内容来源：深圳特区报推荐阅读联系我们对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师，可选择以下方式和我们联系，我们将及时为您进行详细的介绍：1.

回首2022年，“华大时空”知识库努力传递、共享时空及单细胞多组学在个体发育、生命演化、疾病病理等生物医学领域的应用前沿知识，共推出了7期时空及单细胞多组学文献追踪月度速览，30期精选主题文献的时空简讯（自有科研成果专题3篇），41篇代表性文献的深度解读（自有科研成果15篇）。翘首2023年，“华大时空”知识库将继续秉承学术至上的原则，为读者产出时空及单细胞多组学技术与应用的高质量内容。在此，我们总结了2022年全年推送的时空及单细胞多组学技术与应用的解读合辑，供参考（点击题目即可查看文章）。2022

针对单细胞、空间组学在生命科学领域的应用，我们通过检索PubMed数据库，共追踪到2022年12月1日-31日期间发表的179篇文章（包括article、review等；IF≥5），按研究领域分类梳理，详见下表。此外，我们按影响因子排名和广谱性遴选了30篇进行概要解读，供大家参考。扫描文末二维码，即可获取全部179篇含研究物种、组织/器官和疾病信息的文献清单。

点击图片解锁时空档案，最后有彩蛋哟~辞旧迎新新展望，不负初“芯”新征程！2023即将开启，华大时空将继续助力科学发现，与科研工作者一起共谱华章。由“华大时空大事件”组成的时空新年定制台历，助您在2023事业“兔”飞猛进，再创佳绩！领取方式：在留言区分享2022年的科研趣事或立下2023年的新年flag，我们将挑出5条走心留言各送1套时空台历。领取时间：留言时间截至2023年1月1日24:00（台历将在收到私信地址7个工作日内寄出）。推荐阅读联系我们对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师，可选择以下方式和我们联系，我们将及时为您进行详细的介绍：1.

来自美国加州大学的冯根生团队，利用scRNA-seq绘制了从新生儿到成年的单细胞分辨率小鼠肝脏发育图谱，证明了肝细胞与内皮细胞、星状细胞和Kupffer细胞协同作用的功能成熟，以及巨噬细胞群的短暂出现。这项研究提供了一个全面的图谱，涵盖了所有的肝细胞类型，并有助于进一步剖析肝脏发育、代谢和疾病。该文章在2022年2月7日发表在Developmental