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RNAmod: m6A peak 注释神器
像诗像风也像秋
1引言
分享一个 m6A peak 在线注释 的强大在线工具 RNAmod。功能非常多,比如 peak 注释
,Go/KEGG 富集分析
,绘制 metagene plot
,motif 富集
等等。
网址:
https://bioinformatics.sc.cn/RNAmod/index.php
文章:
发了一篇 NAR:
可以单个样本也可多样本分析!
2基本使用
选择物种及上传我们的 peak 文件,直接粘贴也可:
然后是一些参数的选择,默认即可,最后 submit 提交等待:
会显示当前进行到哪一步了:
流程
结果
还可以打包下载所有的数据文件,对图不好看的还可以拿数据自己重新绘图哦!
3测试结果
我自己试了一个 peak 数据进行注释:
类型注释:
基因类型注释:
metegene-plot:
motif 富集:
通路富集结果:
其它富集:
其他的就不一一展示了。
下载结果
最后在这里下载:
欢迎加入生信交流群。加我微信我也拉你进 微信群聊 老俊俊生信交流群
哦,数据代码已上传至QQ群,欢迎加入下载。
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所以今天你学习了吗?
今天的分享就到这里了,敬请期待下一篇!
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