2个重要报告，揭秘时空技术在病理应用、肿瘤研究上的潜力和前景
精彩报告
作为全球领先、能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术，华大Stereo-Seq时空组学技术可以全面应用于器官结构，生命发育、生命演化、人类疾病等重大问题研究，推动生命科学和医学领域的发展，带来生命科学领域第三次科技革命。也由此，华大Stereo-Seq时空组学技术备受学界关注。在日前举行的多起学术活动中，华大多位老师受邀出席作学术报告。以下是部分报告精华。
报告1
日前，2021年临床分子检测基础与应用研讨会于北京顺利举行。华大生命科学研究院时空组学首席科学家陈奥研究员受邀参会，并作了题为《时空组学技术及其病理应用》的报告。
报告开始陈奥研究员阐述了生命科学领域的重要科学革命，从显微技术到基因测序，再到如今的时空技术，生命全景时空图谱绘制将不再遥远。生命数据将从单一组学向时空多组学迈进，更小的像素点、更密的像素间距、更广的市场发展，将成为前沿技术的发展方向。
目前华大自主研发的Stereo-Seq时空组学技术则具有厘米级全景视场，最大可扩展到13*13cm，亚细胞分子定位，分辨率500nm。报告中，陈奥研究员列举了时空组学技术在器官图谱、个体发育、数字病理的应用案例，其中包括猕猴全脑空间转录组的部分结果、完善的小鼠脑3D图谱、小鼠胚胎发育7个时期的时空结果等。
陈奥研究员就时空数字病理探索进行了展开讨论，提到病理诊断决定临床诊治效果，现有染色拍照、bulk-seq等技术在疾病诊断中分辨率偏低，未充分考虑不同分子、不同细胞的位置信息。现阶段在开发时空数字病理工具，包括时空技术的工作站、AI分析及数字病理报告。时空数字病理探索包含鉴别诊断、指导治疗、风险评估三个方面。
在鉴别诊断层面，时空技术用于鉴别不同的组织区域、鉴别不同类型的组织学分型。肺癌案例中样本可以通过时空组学数据得到一致的形态学划分，结直肠癌案例中时空组学数据鉴定到癌组织的marker gene的分布与H&E染色有较好的对应关系。
指导治疗层面，时空技术可实现分子分型的鉴定、免疫浸润的评估和免疫评分的建立，可综合考虑不同类型免疫细胞浸润位置、浸润状态、免疫细胞和肿瘤细胞的位置关系等多维度信息，全面评估患者免疫浸润状态。案例展示了肺癌中脉脉管癌栓鉴定方法开发成果。风险评估层面，时空技术可以用于增殖指数、侵袭及出芽的鉴定及脉管中癌栓鉴定等。案例展示了肺癌的时空数据单细胞精度分析，可进行细胞亚型鉴定及计数。
报告2
在日前举行的首届肿瘤组学空间站峰会（COSS，Cancer Omics Space station summit）上，深圳华大生命科学研究院癌症研究中心主任吴逵博士分享了以《肿瘤时空组学及临床应用前景》的报告。报告中，他首先介绍了在基因组学及后人类基因组时代，基因组技术的发展脉络和趋势，包括突出癌症研究异质性和精准化的趋势。
然后，基于癌症研究中心的工作，他分享了运用多组学和单细胞组学技术在肝癌异质性演化和免疫微环境解析，肝癌多区域与ctDNA测序揭示异质性机制，多发肝癌免疫组学与免疫逃逸机制 ，以及早期复发性肝癌微环境研究的重要进展。
最后，他对近两年基于自主的高分辨率时空组学技术，在癌症精准诊疗研究进行了分享，并展示了华大正在进行的癌症分子病理分型，解析肿瘤微环境下免疫激活/抑制的空间差异，肿瘤组织功能元件鉴别的研究进展。吴逵博士认为，多维时空组技术的发展将加速助力全面认知癌症、实现个体化精准诊疗。
首届COSS由中国抗癌协会肿瘤标志物专业委员会、中国抗癌协会癌症筛查与早诊早治专委会、北京爱谱癌症患者关爱基金会学术支持，华大基因主办。
此外，吴逵博士也在2021基因与精准诊疗高峰论坛上作了《基于时空组学的癌症创新研究与精准医学探索》的专题报告，分享时空组学在精准医学上的创新应用。
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