时空组学新引擎!STOmics Cloud开启数据研究新纪元
随着时空组学技术的发展,海量时空组数据将不断涌现。如何高效智能地对时空数据进行分析,是当前亟需解决的问题。为此,深圳华大生命科学研究院特推出STOmics Cloud。STOmics Cloud的出现,为充分探索时空组学数据提供了一个领先的数据分析平台,它将大大提高生命科学领域的多组学数据分析效率,加速科研进程,助力科研转化。
聚焦数据分析,赋能时空项目
STOmics Cloud聚焦时空组学,以项目为核心,可对项目数据及工具进行高效整合,实现数据分析过程可追溯,结果可复现,知识可分享,项目可协作等完善的项目分析体系。同时提供标准分析、高级分析、高分辨率可视化分析等多维服务,是一个领先的多组学数据分析平台。
2月28日,全新升级的STOmics Cloud(beta)将正式上线,欢迎各位老师登录体验。
▪STOmics Cloud(beta)目前只对已注册用户开放,新用户注册体验敬请期待
多功能上线,助力科研探索
01
高效项目协同,全过程可控可复现
STOmics Cloud以项目为空间,用户可以自定义创建项目,并上传数据、搭建流程、设置分析任务,对项目中的资产进行管理,同时可快速将数据和工具整合进项目中,实现多人在线协同分析。
02
批量标准分析,多组学分析全面支持
时空多组学分析流程(SAW, STOmics Analysis Workflow)是华大自主研发的工具算法,主要应用于时空组学数据的标准分析。SAW整合了多个Stereo-seq空间组基因表达分析工具,这些工具可用于还原以及可视化测序数据在芯片上的空间表达信息。为了高效的完成时空fq到表达矩阵的标准分析,STOmics Cloud支持批量进行SAW标准分析,快速产出表达矩阵结果,加速项目分析研究进程。
03
零代码高级分析,交付报告快速生成
STOmics Cloud高级分析集成常用的聚类、细胞注释、细胞互作、拟时序分析、功能富集分析等算法工具。无生信、编程基础的研究人员也可快速具备分析能力,通过在页面自由调整参数,进行0代码的交互式操作完成高级分析。
STOmics Cloud高级分析操作演示
04
低代码个性分析,科研数据灵活分析
STOmics Cloud部署了Jupyter notebook工具,并提供Python和R语言等相关常用时空软件包环境,用户可以便捷的在网页上进行代码开发,及时获取富媒体结果内容。同时,用户可通过notebook自由安装工具,如stereopy,scanpy,spateo,SingleR等编写代码,完成个性化分析挖掘。
STOmics Cloud个性化分析内测中,正式开放敬请期待
05
高分辨可视化,细胞水平交互探索
StereoMap是华大自主研发的可视化工具,支持图像、表达矩阵等结果的可视化展示。最高可实现500 nm的分辨率,支持cellbin分辨率,提供单细胞级分析视角。同时,细胞分割、组织分割等图像数据、图层可随意叠加展示,高清图像渲染数秒完成,并支持套索、配准等工具,以支持数据深入分析。
06
丰富公开库,优质流程一键复用
利用STOmics Cloud的notebook可实现9大个性化生信分析流程,包括:多样本批次整合、分群聚类、解卷积注释、cellmask手动注释、差异分析、GO&KEGG富集、空间轨迹推断、RNA velocity、Cell cell communication等,用户可一键添加到项目中使用。
公共镜像库中常用的时空镜像,可一键添加到项目中使用
扫码即刻体验新功能
STOmics Cloud(beta)已于2月28日正式上线,已注册用户扫描二维码,即可一键登录,解锁更丝滑、更智能、更全面的时空数据分析体验!未注册用户,请耐心等待,我们会逐步开放注册权限。
cloud.stomics.tech
⬆扫码立即体验
满足用户需求,提供更强大的数据分析工具是STOmics Cloud的核心追求。基于此,STOmics Cloud会定期进行更新迭代,不断完善产品体验。目前,除了已经上线的功能,STOmics Cloud也在根据用户实际科研需求开发新功能,更完善、更智能的功能将陆续上线,敬请期待!
点击阅读原文,解锁STOmics Cloud(beta)全新体验!
推荐阅读
联系我们
对时空组学或单细胞组学整体解决方案感兴趣的老师,可选择以下方式和我们联系,我们将及时为您进行详细的介绍:
1. 在公众号留言;
2. 发送信息至邮箱:
collaboration@stomics.tech;
让我知道你“在看”